Является главной в сети обсерваторий Иркутского Института солнечно-земной физики, который был основан в 1960 году на базе древнейшей в Сибири магнитной обсерватории.
БАО примечательна крупнейшим в России и вторым по мощности в мире вакуумным солнечным телескопом, диаметр объектива которого составляет 1 м. Это единственный на Байкале хромосферный телескоп, предназначенный для регистрации солнечных вспышек и наблюдения за солнечной активностью.
Особое расположение обсерватории наградило ее прекрасными астроклиматическими характеристиками. Это происходит благодаря присутствию локального антициклона и малым восходящим потокам воздуха с холодной поверхности Байкала. С возвышенности, на которой находится БАО, открывается завораживающий вид на самое большое в мире озеро и исток Ангары.
В Байкальской обсерватории проходят лекции, устраиваются экскурсии. Все занятия проводят специалисты фонда содействия строительству Иркутского планетария и Астрономической обсерватории Иркутского государственного университета. Здесь можно увидеть диск Солнца, узнать о его роли в жизни планеты и о том, как с ним взаимодействует Земля.